Genómica de Poblaciones: Sexto Simposio Anual de Genómica de Enfermedades Raras

Patient Worthy tiene el distintivo placer de asistir al Sexto Simposio Anual de Genómica de Enfermedades Raras en la Universidad de Alabama en Birmingham (UAB) este fin de semana. Hoy, escuchamos a investigadores líderes sobre sus esfuerzos en genética para lograr mejores resultados para los pacientes y sus familias.

Iniciativa de Salud Genómica de Alabama (AGHI): Cohorte Afectada

Bruce Korf, MD, PhD y el Director de Genómica de la UAB nos inició, presentando a Anna C. E. Hurst, MD, MS, quien habló sobre la Iniciativa de Salud Genómica de Alabama (AGHI, por sus siglas en inglés) – Cohorte Afectada. El Dr. Hurst nos educó sobre el proceso de secuenciación del genoma completo y el papel que desempeña en el diagnóstico de enfermedades raras. Para este programa, los pacientes suelen remitirlos a AGHI por un médico que envía el formulario en línea, explicando quién es el paciente, las inquietudes médicas del médico, qué pruebas genéticas anteriores han demostrado en el pasado y qué busca su equipo para hacer el trabajo completo. secuenciación del genoma. El AGHI luego decide si el candidato es apropiado para la secuenciación del genoma completo (debe ser un ciudadano de Alabama).

Han aplazado a algunos pacientes, en parte porque hay una lista de espera, el candidato necesita más pruebas o el candidato debe ver a un genecista primero. En muchos de estos casos, el paciente diferido podría eventualmente realizarse la secuenciación del genoma completo. El tiempo de espera para la secuenciación del genoma completo en los casos aceptados es de tres a cuatro meses.

En resumen, este programa está ayudando en el camino del diagnóstico para pacientes con sospecha de trastornos genéticos, y la secuenciación de todo el genoma es cada vez más importante en los resultados de pacientes y familiares.

Luego nos lanzamos a las pruebas genéticas de población en Alabama, presentadas por Kelly East, MS, CGC.

Iniciativa Estatal de Evaluación de la Población para el Riesgo de Salud Genética

¿Por qué es importante que examinemos a la población general? No solo las pruebas genéticas son cada vez más baratas, sino que también estamos empezando a comprender los cambios genéticos y su impacto en el riesgo de enfermedad. Con esta mejora en la comprensión, existe una creciente preocupación por el hecho de que, sin saberlo, las personas están caminando con un alto riesgo de desarrollar una enfermedad. Las pruebas genéticas también son útiles en los casos en que se desconocen los antecedentes familiares debido a la adopción, la mala comunicación, etc.

La Cohorte de Población de AGHI ofrece a los adultos mayores de 18 años y que viven en Alabama, la inscripción para recibir las pruebas de Illumina Global Screening Array. El AGHI está informando sobre los cambios patógenos y probablemente patogénicos en los genes, como lo indica la lista de genes del Colegio Americano de Genética Médica y Genómica (ACMG, por sus siglas en inglés). Para aquellos que no están familiarizados, ACMG publicó una lista de 59 genes que es importante observar e informar porque son impactantes, los riesgos de enfermedad son altos y hay acciones que podemos tomar en estos genes.

El proceso para este programa comienza con la inscripción, a veces por suerte (por ejemplo, un posible participante que pasa por una mesa de reclutamiento). El participante firma un consentimiento informado y, afortunadamente, no hay costo para el candidato. La muestra de sangre del participante se recolecta y se analiza, y luego el candidato recibe los resultados.

De la población en este momento, el 74% son mujeres, por lo que les gustaría aumentar su compromiso con los hombres. Todos menos un condado en Alabama han sido cubiertos en este estudio. El noventa y uno por ciento de los participantes han dado su consentimiento para que sus resultados se almacenen en un biobanco, pero solo el 47% ha aceptado que se envíen los resultados a un proveedor de su elección. Este último resultado bajo probablemente se deba a que los participantes no tienen proveedores de atención médica primaria o no conocen la información de su proveedor.

A cincuenta y siete de los 4231 participantes se les han devuelto resultados procesables (o ~ 1,4% de la población). Los participantes que realmente obtuvieron resultados procesables recibieron una llamada de un asesor genético del estudio y una carta de resultados con información específica e individualizada. Hasta el momento, los genes de riesgo cardíaco y tumoral han sido la mayoría de los resultados encontrados del 1,4%. Dos tercios de esta población habían marcado el historial familiar, pero aproximadamente la mitad de ellos en realidad identificaron su historial familiar por algo irrelevante para los resultados encontrados por AGHI.

Esta iniciativa de evaluación de la población en todo el estado está trabajando actualmente en una encuesta para averiguar cómo la población está utilizando los resultados, es decir, si hablaron con sus médicos, miembros de la familia, pruebas adicionales en sus familias, etc. para ver si las pruebas genéticas han afectado su atención. y el cuidado de sus familias.

SouthSeq: Diagnóstico Genómico de Recién Nacidos Enfermos en Todo el Sur

Luego, escuchamos a Greg Cooper, PhD en SouthSeq: Diagnóstico Genómico para Recién Nacidos Enfermos en Todo el Sur. Específicamente, habló sobre el Proyecto CSER Genómico Pediátrico HudsonAlpha. Este esfuerzo comenzó en 2013 e incluye la colaboración con la Dra. Martina Bebin, Neuróloga de la UAB, y Especialistas en Niños del Norte de Alabama en Huntsville, AL.

Reclutaron a 500 familias con discapacidades intelectuales o del desarrollo, que necesitaban un diagnóstico específico. Luego condujeron secuenciación del genoma en estas familias para identificar las variantes genéticas causales, devolvió esos resultados a las familias y luego evaluó el impacto de los resultados de la información genética en la salud y el bienestar de las familias.

Los investigadores observaron 581 probands en 532 familiares y 1500 individuos, incluidos los padres. El veintiuno por ciento tenía una variante patógena. Normalmente, estos conducen a una condición diagnosticable, por ejemplo, el síndrome de Dravet o el síndrome de Rett.

Un desafío en las enfermedades raras es incluso si se secuencia una gran cohorte, es probable que los trastornos extremadamente raros se manifiesten más de una o dos veces. Por lo tanto, hacer coincidir a los pacientes en los centros de secuenciación de todo el mundo con genotipos/fenotipos raros es necesario para descubrir realmente nuevos trastornos genéticos. GeneMatcher es una herramienta que puede ayudar con el emparejamiento. Como lo expresó el Dr. Cooper, es como Cragislit para genetistas de enfermedades raras.

El Dr. Cooper se refirió a la creciente importancia del nuevo análisis, especialmente en casos de enfermedades raras con fenotipos graves. El re-análisis es crítico no solo a nivel de variante y gen, sino a nivel de paciente. Para este proyecto, los investigadores pueden tratar un caso antiguo como uno nuevo cada 24 meses, para ver si se encuentra algo nuevo en ese paciente. A través de esta práctica, el 15% de los casos originales a los que no se les dio un resultado patogénico, terminó con un resultado patogénico.

Algunas conclusiones clave de este proyecto son:

  • Hay una gran necesidad de más consejeros genéticos.
  • La secuenciación es efectiva en el diagnóstico e investigación de enfermedades pediátricas y del desarrollo neurológico. El valor de esto es significativo, especialmente en el diagnóstico de niños pequeños frente a adultos.
  • Las mejoras rápidas en secuenciación, herramientas analíticas y el intercambio de datos están mejorando el rendimiento de diagnóstico.
  • Deben llegar a poblaciones nuevas y más diversas para mejorar el impacto clínico, entre otras razones.

El programa SouthSeq, que forma parte del CSER, tiene como objetivo realizar una secuenciación genómica en 1500 bebés en UCIN con síntomas que provocan una referencia genética. Trabajarán con hospitales que son rurales, que tienen poblaciones con servicios médicos insuficientes y/o que tienen más candidatos Afroamericanos.

La participación de los interesados ​​es clave para este esfuerzo, por lo que trabajarán para recopilar información de representantes de varios grupos afectados por SouthSeq, incluidos los padres de niños con enfermedades congénitas, médicos, defensores de enfermedades raras, hospitales y administradores de seguros, y líderes comunitarios. Los esfuerzos de participación incluirán encuestas de prueba, reuniones estilo «ayuntamiento» y más, para recopilar reacciones y reajustar según sea necesario.

La inscripción comienza con una enfermera de la UCIN, luego la secuenciación y el análisis del genoma se llevarán a cabo en HudsonAlpha, luego la mitad de los participantes irán en el brazo estándar con un asesor genético para analizar los resultados. La otra mitad obtendrá los resultados de un proveedor de UCIN. Los proveedores de la UCIN están siendo capacitados para hacer esto de una manera segura y efectiva, ya que típicamente un asesor genético está involucrado en este proceso. Por supuesto, los asesores genéticos revisarán los resultados para detectar posibles errores y los riesgos de seguridad asociados.

La escala de resultados tratará de ver los resultados dirigidos hacia el empoderamiento de la familia, cómo la familia entiende los resultados y si consideran que la información es útil o no. Pero el equipo también desea ver si el proveedor de la UCIN es tan efectivo como un asesor genético en la entrega de los resultados, de modo que podamos ampliar las opciones para aquellos que trabajan con familias con variantes genéticas.

En este momento, este proyecto cuenta con 238 personas. El ensayo clínico está programado para comenzar en Abril de este año. En la actualidad, la diversidad ha aumentado con alrededor del 50% de las inscripciones formadas por minorías. Hasta el momento, están viendo resultados similares al primer estudio, con aproximadamente una cuarta parte con una variante positiva que podría conducir a un diagnóstico. Aquellos que tienen un posible resultado de diagnóstico, tienen indicaciones raras como el síndrome de CHARGE.

El Dr. Greg Cooper cerró un estudio de caso sobre una hembra de 4 días de nacida. Regresó negativa por sospechas de afecciones, incluido lo que el médico pensó inicialmente que era una manifestación de miastenia grave. El paciente obtuvo una variante en CHAT, asociada con el Síndrome Miasténico Congénito, que se alinea con la intuición inicial del médico, aunque es ligeramente diferente a la MG. Por lo tanto, los resultados genéticos informaron el tratamiento del infante por parte del médico.

Todos Nosotros Programa de Investigación

Luego escuchamos a nuestro estimado moderador y Director de Genómica de la UAB, el Dr. Bruce Korf, sobre el Programa de Investigación Todos Nosotros. En resumen, este es un esfuerzo de los Institutos Nacionales de la Salud (NIH, por sus siglas en inglés) para recopilar datos de ciudadanos de los Estados Unidos, mayores de 18 años, para informar la entrega de medicamentos de precisión. El objetivo es avanzar rápidamente en la investigación en salud y los avances médicos, a través del desarrollo en la prevención, el tratamiento y la atención individualizados. Mientras que los participantes pueden compartir sus muestras y datos, sus datos e información de identificación personal están protegidos. Los investigadores luego estudiarán los datos para encontrar patrones, y los participantes eventualmente obtendrán reslos datos de sus datos, con la esperanza de informarlos para aprender más sobre su propia salud. En general, los datos deben informar el desarrollo de la atención individualizada. Para obtener más información sobre cómo unirse a este esfuerzo, haga clic aquí.

Impactos de Padres y Pacientes de las Pruebas Genéticas

Terminamos la primera mitad del día escuchando a las familias que recibieron los diagnósticos y cómo eso cambió sus vidas. Una familia habló sobre cómo durante el embarazo, la madre no obtuvo ningún resultado que indicara un trastorno y observó que el embarazo fue muy fácil. El primer par de días después del parto, sin embargo, fue muy abrumador. Después de un año de muchas cirugías y visitas al hospital, la familia recibió un diagnóstico. Su hijo es uno de cada dieciséis con una enfermedad muy rara, y ella expresó su gratitud por lo que considera un diagnóstico rápido, dada la increíble complejidad de su condición.

La familia también está agradecida de saber los detalles porque ahora saben lo que significa el pronóstico y cómo afecta a los futuros hijos de su familia. Si bien todavía hay mucho que aprender sobre la enfermedad rara, esta familia tiene la esperanza de que cuanto más comunes sean las pruebas, más información esté disponible para el público.

Otro miembro de la familia habló que estaba inscrito en el programa SouthSeq. Su hija pasó algunos meses en la UCIN justo después del nacimiento, pero 90 días después de que se tomaron un vil de sangre, recibió un diagnóstico y un tratamiento rápido. Si bien hay muchas terapias, especialistas y visitas al médico, este miembro de la familia siente que hay un gran progreso desde el diagnóstico poco frecuente y la respuesta adecuada al tratamiento.

También escuchamos a una paciente adulta que ya sabía que tenía sarcoidosis pulmonar y espondilitis anquilosante, inscrita en la cohorte de población AGHI mencionada anteriormente. Su historia familiar era tal que todos vivían hasta que eran muy viejos. Ella se inscribió en la Cohorte de Población AGHI con su esposo «por diversión» y, mientras él recibía una carta de resultados, finalmente recibió una llamada telefónica con sus resultados. Si bien no tiene antecedentes cardíacos en su familia, sorprendentemente resultó que tenía una variante genética cardíaca. Después de este descubrimiento, acudió a su cardiólogo pensando que tenía sarcoidosis cardíaca, pero se mostró negativa. Llamó a sus hermanos y les hizo saber acerca de la variante cardíaca y dijeron que no querían que se les realizaran pruebas genéticas. Su cardiólogo sugirió que la hija adulta de este paciente se hiciera una prueba para detectar una variante genética, que aún no se ha hecho la prueba debido a problemas de programación. Por ahora, esta paciente todavía tiene fatiga como resultado de su sarcoidosis y sus objetivos principales son caminar 10,000 pasos por día, subir escaleras y pasear a su perro.

Las pruebas genéticas, específicamente la secuenciación del genoma completo, han sido un tema candente en el mundo de las enfermedades raras durante años. Pero después de enterarse de la aplicación práctica de esto en familias raras y en la población general de Alabama, ofrece la esperanza de que esto se está convirtiendo en un esfuerzo cada vez más común en todo Estados Unidos. El sur siempre ha necesitado más atención hacia los trastornos raros, y la UAB está a la vanguardia de llenar ese vacío.

Como paciente de enfermedades raras, estoy agradecido por sus programas para avanzar en los avances en diagnóstico, tratamiento y atención. ¡Manténgase atento a nuestra cobertura en vivo del Simposio de Pacientes y Cuidadores de Enfermedades Raras de Alabama 2019 mañana!

¿Qué descubrió durante la Semana de las Enfermedades Raras 2010 que vale la pena mencionar?¡Comparta sus anécdotas, ideas y deseos con la comunidad Patient Worthy!
Este artículo ha sido traducido al español lo mejor posible dentro de nuestras habilidades. Reconocemos que tal vez no hayamos captado todas las matices y especificidades de su región, por lo que si tiene alguna sugerencia o desea ayudarnos a refinar nuestras traducciones, envíe un correo electrónico a [email protected].

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